Nous savons qu’une série de facteurs environnementaux influence la composition de notre microbiote intestinal. Notre alimentation, notre lieu de vie, mais également nos gènes, ont un impact sur les espèces de bactéries qui sont les plus susceptibles d’habiter nos intestins. Les chercheurs savent également que la composition de notre microbiote intestinal change au fur et à mesure que nous vieillissons. Le vieillissement entrainant la disparition de certaines espèces clé de bactéries, est-il envisageable de  développer des thérapies anti-âge reposant sur notre microbiote intestinal ? La première étape vers cet objectif consiste à déterminer si une analyse de microbiome intestinal permet de prédire l’âge d’un individu. C’est l’objet de cette étude, dont les résultats ont été publiés en février dernier par mSystems.

Dans une approche collaborative, le laboratoire du Docteur Rob Knight, Directeur du Centre de l’UC San Diego pour l’innovation en matière de microbiome (États-Unis), a développé un outil de prédiction à partir des informations fournies par différents microbiomes humains. L’outil fait appel au « machine learning » pour prédire l’âge avec une précision plus ou moins grande.

Les auteurs ont combiné plusieurs études, menées dans différents pays, pour déterminer quel microbiome corporel pouvait prédire le plus précisément l’âge. Intégrant 8959 échantillons, provenant de 10 études, cette étude représente l’étude la plus complète sur le microbiome et l’âge.

Ainsi ils ont découvert que le microbiome cutané fournissait la meilleure prédiction de l’âge, avec une justesse d’estimation avoisinant les 3,8 ans pour le microbiome cutané, 4,5 ans pour le microbiome buccal et 11,5 ans pour un le microbiome fécal. Par ailleurs, en accord avec des travaux précédents, il existerait un lien le microbiote intestinal et genre de l’individu. En revanche, ils n’ont pas mis en évidence de lien entre genre de l’individu et microbiote buccal ou cutané.

Enfin, cette étude montre surtout que le « machine learning » est capable d’utiliser les informations fournies par le microbiome humain pour prédire l’âge avec précision. Cette étude met également l’accent sur le fait que les données obtenues à partir des microbiomes intestinal, buccal et cutané peuvent toutes être utilisées pour prédire l’âge mais que la prédiction s’affine avec les données apportées par le microbiome cutané. De prochaines étapes pourraient inclure des tests de microbiome accessibles et pratiques visant à déterminer les signes de vieillissement accéléré ou retardé chez les personnes âgées ou les individus souffrant de maladies chroniques.

 

REFERENCES :

Huang, Shi, Niina Haiminen, Anna-Paola Carrieri, Rebecca Hu, Lingjing Jiang, Laxmi Parida, Baylee Russell, et al. 2020. “Human Skin, Oral, and Gut Microbiomes Predict Chronological Age.” MSystems 5 (1). https://doi.org/10.1128/msystems.00630-19.