Est une espèce bactérienne présente l’intestin de nombreuses personnes, et ce, sans leur porter préjudice. Dans la communauté microbienne des intestins il existe un équilibre entre les « bonnes » bactéries (bénéfiques) et celles qui peuvent être potentiellement dangereuses (pathogènes). Les problèmes commencent quand un déséquilibre se produit, souvent suite à un traitement antibiotique. Si le nombre de C. difficile grandit démesurément, divers symptômes, tels que diarrhée ou inflammation du colon, peuvent commencer à se manifester.

Les infections par C. difficile touchent généralement des patients ayant récemment subi un traitement antibiotique ou se trouvant à l’hôpital ou dans des unités de soins de longue durée. La transplantation de microbiote fécal est actuellement à l’étude afin d’évaluer son efficacité pour lutter contre ces infections. Par ailleurs, les probiotiques pourraient aider à restaurer un microbiote intestinal efficace pour contrôler une croissance excessive de C. difficile.