La communauté microbienne hébergée dans notre intestin est une combinaison unique de différents types et quantités de bactéries. Il ne s’agit pas d’un ensemble bactérien permanent, mais plutôt d’un groupe en évolution qui peut être influencé par notre régime alimentaire, des facteurs environnementaux, des traitements médicamenteux, etc. La recherche scientifique dans le cadre du projet européen MetaHit (2008 – 2012) est parvenue à identifier et caractériser trois groupes principaux de microbiotes ou entérotypes.